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Jacques Berchtold effectue ses études à Genève, où il obtient un Doctorat ès lettres en 1994. Il enseigne ensuite la littérature française de la Renaissance au XIX^e siècle à la Faculté des lettres de l’UNIGE (1986-2008) ainsi qu’au sein des universités de Berne, de Yale, et de Johns Hopkins, aux Etats-Unis. Il a également été pensionnaire de l'Institut suisse de Rome. Après avoir soutenu une Habilitation à diriger des recherches, il est de 2001 à 2008 professeur de littérature française du XVIII^e siècle à l’Université Paris 3-Sorbonne, puis, jusqu’en 2014, à Paris 4-Sorbonne.

Directeur de la Fondation Martin Bodmer à Cologny depuis 2014, il a notamment mené à bien de nombreux projets en collaboration avec l’UNIGE. Parmi ses nombreuses publications, ses travaux sur Lesage, Diderot, Rousseau ou encore Flaubert concernent directement le lien entre littérature, humanisme et médecine. Il travaille également à mettre en perspective les savoirs biomédicaux au regard des dimensions historique, sociale et artistique de la médecine. En témoignent notamment ses nombreuses contributions marquant le 200^e anniversaire, en 2016, de la rédaction du célèbre roman de Mary Shelley «Frankenstein»: exposition majeure, des publications et des conférences. Il est nommé professeur titulaire au Département de santé et médecine communautaires de la Faculté de médecine de l’UNIGE en 2018 et prend sa retraite de la Faculté en septembre 2024, tout en conservant jusqu’en 2026 sa fonction de direction de la Fondation Martin Bodmer.